| 1 | 12 PTN LPTK Indonesia | Kerjasama dalam Penyelenggaraan dan Pengembangan Kelembagaan | 17 Juni 2016 s.d 17 Juni 2021 | MOU | | Meningkatkan dan memupuk hubungan kelembagaan antara kedua belah pihak dalam melaksanakan Tri Dharma Perguruan Tinggi yang meliputi bidang pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat |
| 2 | ABIPA BALI | Program pelatihan guru BIPA | 22 April 2015 s.d 24 April 2015 | MOA | KUIK | peningkatan kompetensi pengajar BIPA UNY |
| 3 | ASOSIASI PROFESI PENDIDIK EKONOMI INDONESIA (ASPROPENDO) | Kerjasama Tri Dharma Perguruan Tinggi bidang Pendidikan Ekonomi dan Ekonomi Pendidikan | 18 Mei 2015 s.d 18 Mei 2019 | MOA | FE UNY | |
| 4 | ASOSIASI PSIKOLOGI POSITIF INDONESIA (AP2I) | Penyelenggaraan semiloka psikologi positif dan pembukaan AP2I wilayah Jawa Tengah dan D.I Yogyakarta | 13 Desember 2019 s.d 19 Desember 2020 | MOA | FIP (PSIKOLOGI) | Meningkatkan hubungan kemitraan dalam pengembangan sumber daya manusia dan pengembangan ilmu melalui kegiatan "Semiloka Positif dan Pembukaan AP2I wilayah Jawa Tengah dan D.I Yogyakarta |
| 5 | Akademi Akuntansi YKPN | Pemanfaatan tenaga pengajar FBS (PBI dan PBSI) untuk mengajar di AA YKPN | 10 Juni 2019 s.d 9 Juni 2020 | MOA | Jurusan Pebdidikan Bahasa Inggris dan Pendidikan Bahasa dan Sastra Indonesia FBS | |
| 6 | Akademi Angkatan Udara | Pendidikan, Penelitian, Pelatihan dan Pengembangan IPTEK serta Pengabdian Kepada Masyarakat | 31 Agustus 2016 s.d 31 Agustus 2021 | MOU | Universitas Negeri Yogyakarta, Bidang IV, Bidang I, LPPMP | Saling mendukung dalam peningkatan mutu pendidikan dan pelaksanaan tri darma perguruan tinggi |
| 7 | Akademi Keperawatan Notokusumo | Peningkatan Keterampilan Dasar Teknik Instruksional (PEKERTI) | 14 Februari 2017 s.d 14 Februari 2018 | MOA | LPPMP | Peningkatan Kualitas SDM Akper Notokusumo |
| 8 | Akademi Manajemen Administrasi Yogyakarta | Pelaksanaan Kegiatan Pelatihan Praktik Manajemen Kearsipan dan Teknologi Perkantoran | 2 Desember 2019 s.d 31 Desember 2019 | MOA | FE UNY Pendidikan Administrasi Perkantoran | |
| 9 | BALI TV | "PENGEMBANGAN KEWIRAUSAHAAN DI KALANGAN MAHASISWA DAN SARJANA " | 6 Maret 2018 s.d 6 Maret 2021 | MOU | LPPMP | "PENGEMBANGAN KEWIRAUSAHAAN DI KALANGAN MAHASISWA DAN SARJANA " |
| 10 | BKD Bantul | Pelaksanaan Pendidikan Kelanjutan Studi Guru Olah Raga Kab. Bantul di PJKR UNY | 31 Agustus 2015 s.d 31 Agustus 2018 | | FIK, PJKR | wujud penerapan Tri Dharma Perguruan Tinggi melalui penyediaan kesempatan guru-guru yang belum menempuh pendidikan S1 untuk melanjutkan pendidikan S1 PJKR UNY |
| 11 | BKKBN DIY | Kerja Sama dalam Bidang Pendidikan, penelitian, dan Pengembangan SDM | 14 April 2015 s.d 14 April 2020 | MOU | LPPM | Berpatisipasi dalam mendukung program BKKBN merlalui penelitian |
| 12 | BPPSDMK KEMENKES RI | Penyelenggaran Pendidikan Program Sarjana bagi Peserta Program Tugas Belajar Sumber Daya Manusia Kesehatan | 23 Oktober 2017 s.d 23 Oktober 2019 | MOA | FMIPA | |
| 13 | BPSDM Kementerian Kesehatan | Beasiswa S1 dan Program Pascasarjana | 1 Januari 2018 s.d 31 Desember 2018 | MOA | Pasca Sarjana dan FMIPA | "PENYELENGGARAAN PENDIDIKAN PROGRAM SARJANA DAN PROGRAM PASCASARJANA BAGI PESERTA PROGRAM TUGAS BELAJAR SUMBER DAYA MANUSIA KESEHATAN " |
| 14 | BRI Syariah | Pelaksanaan Mini Banking | 30 September 2016 s.d 30 September 2021 | MOA | FE UNY | Pelatihan, Penyelenggaraan Mini Banking |
| 15 | BTN | Penyediaan Jasa Layanan Kredit/Pembiayaan Pendidikan untuk mahasiswa, dosen, dan karyawan di UNY | 10 April 2018 s.d 10 April 2021 | MOA | Bagian Keuangan UNY | |
| 16 | Badan Arsip dan Perpustakaan Provinsi Jawa Tengah | Pengelolaan kearsipan dan pengembangan perpustakaan | 25 Juni 2012 s.d 24 Juni 2015 | MOA | | Peningkatan SDM dan berbagi pengetahuan tentang pengelolaan pengarsipan dan pengembangan perpustakaan |
| 17 | Badan Penelitian dan Pengembangan Kemendikbud | pelaksanaan pemindaian ujian nasional tahun pelajaran 2015/2016 | 29 Maret 2016 s.d 31 Desember 2016 | MOA | BAKI | Partisipasi dalam pelaksanaan Ujian Nasional |
| 18 | Badan Perencanaan Pembangunan, Penelitian dan Pengembangan Daerah | Pembuatan Kebijakan strategis dan inovatif serta rencana tindak lanjut mengenai peningkatan mutu pendidikan dasar | 5 Mei 2018 s.d 30 November 2018 | MOA | LPPM UNY | terbentuknya Kebijakan strategis dan inovatif serta rencana tindak lanjut mengenai peningkatan mutu pendidikan dasar |
| 19 | Badan Standardisasi Nasional | Pembinaan dan Pengembangan Standardisasi dan Penilaian Kesesuaian | 16 November 2016 s.d 16 November 2021 | MOU | Bagian Kerja Sama | Seminar Nasional Bersama antara UNY dan BSN dengan mengundangan pengusaha UMKM lokal untuk sosialisasi Standardisasi produk |
| 20 | Balai Pelestarian Situs Manusia Purba Sangiran | penyelenggaraan penelitian kolaboratif, mengenai keilmuan evolusi, penyelenggaraan pendidikan kolaboratif dalam bentuk kuliah umum, diskusi, seminar, PKL, dan kunjungan | 1 Agustus 2016 s.d 1 Agustus 2021 | MOA | FMIPA | Pemanfaatan literatur, pemakaian alat, dan pengamatan kompleks situs, pemanfaatan dan penerapan hasil penelitian dan pengkajian |